Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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