Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc8E9PWG2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc8E9PWG2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms