Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccdc175E9PVB3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccdc175E9PVB3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms