Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clrn2B2RVW2 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms