Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nipsnap3aB1AWZ3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms