Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atp8b5A3FIN4 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp8b5A3FIN4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atp8b5A3FIN4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atp8b5A3FIN4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms