Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ccdc163A2AGD7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc163A2AGD7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms