Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm5938A2AEN9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Gm5938A2AEN9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm5938A2AEN9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms