Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PtprfA2A8L5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprfA2A8L5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms