Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms