Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf346Q9R0B7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Znf346Q9R0B7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Znf346Q9R0B7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms