Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnnt3Q9QZ47 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnnt3Q9QZ47 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms