Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Col5a3Q9JLI2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms