Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hmgn5Q9JL35 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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