Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Upk3aQ9JKX8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Upk3aQ9JKX8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Upk3aQ9JKX8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms