Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Chrac1Q9JKP8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Chrac1Q9JKP8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chrac1Q9JKP8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Chrac1Q9JKP8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chrac1Q9JKP8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chrac1Q9JKP8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Chrac1Q9JKP8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms