Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Usp29Q9ES63 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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