Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X3

Dusp3, Dual specificity protein phosphatase 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp3Q9D7X3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Dusp3Q9D7X3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms