Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pfn4Q9D6I3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms