Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gabra4Q9D6F4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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