Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sec23bQ9D662 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms