Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Phf6Q9D4J7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms