Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syce1Q9D495 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syce1Q9D495 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms