Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx29Q9D3S3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Snx29Q9D3S3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx29Q9D3S3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms