Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Krt20Q9D312 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Krt20Q9D312 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms