Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed3Q9D0L1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed3Q9D0L1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Zbed3Q9D0L1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zbed3Q9D0L1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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