Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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