Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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MINDY3Q9CV28 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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MINDY3Q9CV28 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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