Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Smurf1Q9CUN6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Smurf1Q9CUN6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Smurf1Q9CUN6 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smurf1Q9CUN6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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