Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atg12Q9CQY1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms