Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms