Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp16Q99LG0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 461.1 ms