Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim11aQ99J19 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Smim11aQ99J19 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim11aQ99J19 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Smim11aQ99J19 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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