Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctu1Q99J10 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctu1Q99J10 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms