Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Abcf3Q8K268 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms