Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FgbQ8K0E8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms