Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LgsnQ8CIX8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms