Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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SbsnQ8CIT9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsnQ8CIT9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsnQ8CIT9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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