Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ercc8Q8CFD5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms