Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col6a6Q8C6K9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col6a6Q8C6K9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col6a6Q8C6K9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col6a6Q8C6K9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Col6a6Q8C6K9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Col6a6Q8C6K9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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