Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ssuh2Q8C3L1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms