Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

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Length 1,358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnrQ8BYI9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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TnrQ8BYI9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TnrQ8BYI9 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms