Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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