Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc29Q80VM3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc29Q80VM3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc29Q80VM3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ttc29Q80VM3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ttc29Q80VM3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms