Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1cQ7TSF0 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms