Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Shq1Q7TMX5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shq1Q7TMX5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Shq1Q7TMX5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shq1Q7TMX5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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