Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atg16l2Q6KAU8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Atg16l2Q6KAU8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atg16l2Q6KAU8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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