Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Jmjd1cQ69ZK6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms