Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Usf2Q64705 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms