Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrmQ64674 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrmQ64674 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms